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• FFPE样本建库的方法及其应用 公开日期：2021-06-22 公开号：CN113005525A 申请号：CN202110506226.9
  发明 FFPE样本建库的方法及其应用

  • 申请号：CN202110506226.9
  • 公开号：CN113005525A
  • 公开日期：2021-06-22
  • 申请人：纳昂达（南京）生物科技有限公司

  本发明提供了一种FFPE建库的方法及其应用。该方法包括：通过利用内切酶进行酶切片段化，对片段化DNA依次进行末端修复加A及接头连接，对连上接头的DNA片段进行PCR扩增，得到测序文库，其中内切酶具有如下功能：a)在DNA缺口处切割；b)保留双链末端突出碱基部分。由于FFPE在固定的过程中和固定之前都有带来降级和部分碱基的脱落，该方法充分利用FFPE的本身的缺口问题，能够在缺口处断裂DNA片段的酶打断DNA后结合正常的补平加A、连接接头和PCR扩增的方式进行建库，解决了由于FFPE本身的损伤和打断损伤不兼容导致的建库效率低的问题，从而解决了降解比较严重的样本难以建库的问题。

  发布时间：2023-06-14 12:08:39

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• 一种具有阿尔法螺旋结构的拟抗体筛选库、其构建方法及应用 公开日期：2021-06-18 公开号：CN112981543A 申请号：CN202110230903.9
  发明 一种具有阿尔法螺旋结构的拟抗体筛选库、其构建方法及应用

  • 申请号：CN202110230903.9
  • 公开号：CN112981543A
  • 公开日期：2021-06-18
  • 申请人：北京创智智能健康技术研究院有限公司

  本发明涉及蛋白质类药物筛选系统，具体涉及一种具有阿尔法螺旋结构的拟抗体筛选库、其构建方法及应用。本发明提供用于拟抗体筛选的DNA库，由多个DNA分子组成，所述多个DNA分子具有如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列；所述核苷酸序列中的N为A，T，G或C，K为G或T。还提供一种RNA库，是由所述DNA库经转录反应获得。还提供一种拟抗体筛选库，是由所述RNA库经体外无细胞表达获得的RNA‑拟抗体库，或者由所述RNA‑拟抗体库经反转录获得的cDNA‑拟抗体库。还提供一种筛选针对靶蛋白质的拟抗体的方法，该方法使用本发明的拟抗体筛选库进行筛选，可得到高效及特异结合靶蛋白质的拟抗体。

  发布时间：2023-06-11 13:31:06

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• 一种sgRNA文库构建方法 公开日期：2021-06-18 公开号：CN112981544A 申请号：CN202110213880.0
  发明 一种sgRNA文库构建方法

  • 申请号：CN202110213880.0
  • 公开号：CN112981544A
  • 公开日期：2021-06-18
  • 申请人：通用生物系统（安徽）有限公司

  本发明公开了一种sgRNA文库构建方法，包括以下步骤：第一步、sgRNA设计；第二步、上下游引物合成；第三步、构建sgRNA文库；所述的sgRNA由PCR扩增得到，涉及n条特异性引物Fn1，Fn2，Fn3，—Fnn，一条通用引物R；其中，特异性引物Fn1与载体5’端有20‑50bp同源，通用引物R与载体3’端有20‑50bp同源，且二者之间有15‑50bp的同源，与传统的退火连接方法相比，本发明通过PCR的方法得到混合sgRNA库，大大节省引物合成成本，提高合成产量。本发明提供了一种高通量、高效率的sgRNA基因文库构建方法。

  发布时间：2023-06-11 13:30:27

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• 一种On-DNA Aldol反应方法 公开日期：2021-06-11 公开号：CN112941637A 申请号：CN202011426217.0
  发明 一种On-DNA Aldol反应方法

  • 申请号：CN202011426217.0
  • 公开号：CN112941637A
  • 公开日期：2021-06-11
  • 申请人：成都先导药物开发股份有限公司

  本发明涉及一种On‑DNA Aldol反应方法，该方法以On‑DNA醛基化合物和α氢醛基或酮基化合物为原料，在催化剂存在下得到On‑DNA产物。该方法能够在有机溶剂/水相的混合水相中进行，操作简单，不引入金属类试剂，环境友好，适合使用多孔板进行的DNA编码化合物库的合成。

  发布时间：2023-06-11 12:53:58

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• 一种适用于简化转录组测序的文库构建方法及配套试剂盒 公开日期：2021-06-11 公开号：CN112941636A 申请号：CN202110359574.8
  发明 一种适用于简化转录组测序的文库构建方法及配套试剂盒

  • 申请号：CN202110359574.8
  • 公开号：CN112941636A
  • 公开日期：2021-06-11
  • 申请人：武汉博越致和生物科技有限公司

  本发明提供了一种适用于简化转录组测序的文库构建方法及配套试剂盒，包括以下步骤：步骤A：总RNA提取与质量控制，进行RNA标记，反转录成cDNA；步骤B：对cDNA进行片段化文库的构建，从而得到简化转录组测序文库。本发明与传统的转录组测序文库构建方法的不同在于：在文库准备过程中，将单个“条形码”序列添加到每个DNA片段中，以便在分析最终数据之前对每个片段进行识别和分类，从而显著提高转录组测序文库的产量，保证数据产出的稳定性。

  发布时间：2023-06-11 13:02:36

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• 一种提高文库转化率的二代测序建库试剂盒及其方法 公开日期：2021-06-11 公开号：CN112941635A 申请号：CN202011620397.6
  发明 一种提高文库转化率的二代测序建库试剂盒及其方法

  • 申请号：CN202011620397.6
  • 公开号：CN112941635A
  • 公开日期：2021-06-11
  • 申请人：上海迪赢生物科技有限公司

  本发明涉及生物技术领域的方法及试剂盒，具体而言，具体为一种提高文库转化率的二代测序建库试剂盒及其方法，特别适用于微量样本的二代测序应用；所述试剂盒包括：酶混液，包括第一酶混液、第二酶液和第三酶混液；所述第一酶混液由T4多聚核苷酸激酶、T4DNA聚合酶、Klenow片段和Taq酶按照3:1:2:1的比例混合而成；所述第二酶液为T4 DNA连接酶；所述第三酶混液为2X QuarTaq HiFi HotStart混合液；缓冲液，所述缓冲液包括第一酶混液所对应的第一缓冲液和所述第二酶液所对应的第二缓冲液，所述第二缓冲液由浓度为0.1‑0.6M的Tris‑HCl、浓度为0.05‑0.1M的MgCl2、浓度为0.01‑0.05M的DTT、浓度为1‑10mM的ATP、浓度为30％‑50％的PEG6000和浓度为10‑20％的1,2丙二醇混合而成；接头、index序列和通用引物。

  发布时间：2023-06-11 12:54:12

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• 用于纳米孔测序的单细胞或微量样本全长转录组文库构建方法 公开日期：2021-05-28 公开号：CN112853503A 申请号：CN202110312522.5
  发明 用于纳米孔测序的单细胞或微量样本全长转录组文库构建方法

  • 申请号：CN202110312522.5
  • 公开号：CN112853503A
  • 公开日期：2021-05-28
  • 申请人：北京百迈客生物科技有限公司

  本发明涉及单细胞测序技术领域，具体涉及用于纳米孔测序的单细胞或微量样本全长转录组文库构建方法。本发明提供的文库构建方法包括：将单细胞或微量样本裂解后，采用Smart‑seq2方法将mRNA反转录制备cDNA，以所述cDNA为模板进行PCR扩增，将PCR扩增产物进行FFPE和末端修复，再连接纳米孔测序接头。该方法可以实现真正的单细胞测序，且兼具转录本覆盖度高、分辨率高、灵活性强的优点，可应用于单细胞的差异基因表达分析、转录本结构分析、全长isoform鉴定等。

  发布时间：2023-06-11 12:13:58

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• 小鼠表观遗传基因敲除筛选文库及其构建方法 公开日期：2021-05-28 公开号：CN112853502A 申请号：CN202110050866.3
  发明 小鼠表观遗传基因敲除筛选文库及其构建方法

  • 申请号：CN202110050866.3
  • 公开号：CN112853502A
  • 公开日期：2021-05-28
  • 申请人：中国医学科学院基础医学研究所

  本发明涉及小鼠表观遗传基因敲除筛选文库及其构建方法，小鼠表观遗传基因敲除筛选文库包括靶向表观遗传相关基因的SgRNA表达质粒，靶向表观遗传相关基因包括赖氨酸乙酰转移酶基因、组蛋白去乙酰酶基因、组蛋白赖氨酸甲基转移酶基因、组蛋白赖氨酸去甲基化酶基因、蛋白质精氨酸甲基转移酶基因、组蛋白识别、DNA甲基化相关基因、RNA甲基化相关基因、染色质重塑复合物基因、染色质组装及组蛋白伴侣基因。本发明构建的基因文库，为双质粒表达系统，质粒相对较小，构建比较容易操作；同时筛选文库仅仅针对表观遗传基因，文库相对较小，进行单细胞测序相对容易进行数据分析。

  发布时间：2023-06-11 12:06:23

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• 一种一锅法On-DNA铃木反应方法 公开日期：2021-05-25 公开号：CN112831843A 申请号：CN202011274633.3
  发明 一种一锅法On-DNA铃木反应方法

  • 申请号：CN202011274633.3
  • 公开号：CN112831843A
  • 公开日期：2021-05-25
  • 申请人：成都先导药物开发股份有限公司

  本发明涉及一种一锅法On‑DNA铃木反应的方法，该方法在硼酸酯、亚硝酸酯和自由基引发剂存在下，将胺基化合物转换成硼酸酯化合物，然后与On‑DNA芳基卤代化合物在钯催化剂下“一锅法”得到On‑DNA产物。本发明方法收率高，反应条件温和，能够通过胺基化合物大规模引入硼酸合成模块，特别是不易分离纯化的硼酸模块，适合使用多孔板进行的DNA编码化合物库的合成。

  发布时间：2023-06-11 11:34:01

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• 一种抗原抗体共展示方法用于膜抗原的抗体文库筛选 公开日期：2021-05-18 公开号：CN112813505A 申请号：CN202011601072.3
  发明 一种抗原抗体共展示方法用于膜抗原的抗体文库筛选

  • 申请号：CN202011601072.3
  • 公开号：CN112813505A
  • 公开日期：2021-05-18
  • 申请人：上海交通大学

  本发明公开了一种抗原抗体共展示方法用于膜抗原的抗体文库筛选。本发明所要针对目标抗原为膜蛋白，将目标抗原表达在细胞膜上，并将该目标抗原与细胞膜内侧的效应蛋白结构域偶联。同时将针对目标抗原的特异性抗体文库通过跨膜肽表达在细胞膜表面，并且通过跨膜肽与胞内效应蛋白结构域偶联。如果细胞表面抗体和抗原双方能够发生作用，与双方所融合表达的效应蛋白结构域会重新组装成为有功能的效应蛋白，通过转录报告基因报告所述抗体与抗原的成功结合。采用本发明的技术方案可以快速有效的筛选出针对目标抗原的特异性抗体。

  发布时间：2023-06-07 12:38:34

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