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• 一种去除高丰度RNA的测序文库及其构建方法 公开日期：2023-09-26 公开号：CN112680797A 申请号：CN202110153073.4
  发明 一种去除高丰度RNA的测序文库及其构建方法

  • 申请号：CN202110153073.4
  • 公开号：CN112680797A
  • 公开日期：2023-09-26
  • 申请人：广州大学

  本发明属于高通量测序技术领域，公开了一种去除高丰度RNA的测序文库及其构建方法。所述构建方法包括以下步骤：(1)提取样品中的总RNA，将所有RNA连接3’接头；(2)RNA片段化处理；(3)RNA连接5’接头；(4)设计DNA探针，并与高丰度RNA进行杂交，形成DNA：RNA杂交链；(5)切割DNA：RNA杂交链，使高丰度RNA断开与3’接头的连接；(6)经反转录和PCR扩增，得到去除高丰度RNA的测序文库。该构建方法能够去除高通量测序文库中高丰度RNA，大大降低高丰度RNA的比例，并具有实验步骤简单、成本低、效果好的优势，可提升大规模RNA平行测序文库的质量，节约成本。

  发布时间：2023-06-04 11:40:35

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• 一种原核生物的酵母cDNA文库的构建方法 公开日期：2023-09-22 公开号：CN116791212A 申请号：CN202310337919.9
  发明 一种原核生物的酵母cDNA文库的构建方法

  • 申请号：CN202310337919.9
  • 公开号：CN116791212A
  • 公开日期：2023-09-22
  • 申请人：上海欧易生物医学科技有限公司

  本发明公开了一种原核生物的酵母cDNA文库的构建方法，提取原核生物总RNA，使用逆转录引物进行逆转录合成cDNA；利用LD‑PCR对单链cDNA进行扩增获得双链cDNA，再使用DSN酶对双链cDNA进行均一化处理；再通过均一化后一轮扩增获得含有文库重组接头的cDNA，然后同源重组到文库载体，转化到大肠杆菌DH10B中进行文库保存和文库质粒提取，然后将文库质粒转化到相应的酵母菌株中制备成酵母cDNA文库。本发明所述方法以总RNA为模板，避免了由于rRNA去除探针的非特异性导致的mRNA产物数据丢失；经过DSN酶处理后，mRNA来源的cDNA得以保留，而rRNA来源的cDNA被消化掉，从而可以构建成更高质量，mRNA完整性更好，unigene含量更高的原核生物酵母cDNA文库。

  发布时间：2023-09-24 08:24:16

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• 一种细胞游离DNA的建库方法和建库试剂盒 公开日期：2023-09-19 公开号：CN116770443A 申请号：CN202310726712.0
  发明 一种细胞游离DNA的建库方法和建库试剂盒

  • 申请号：CN202310726712.0
  • 公开号：CN116770443A
  • 公开日期：2023-09-19
  • 申请人：赛纳生物科技（北京）有限公司

  本发明公开了一种细胞游离DNA的建库方法，包括：提供cfDNA，在包含酶的反应体系内进行末端修复和磷酸化修饰，得到修复后cfDNA；在连接反应体系内，将至少部分为双链的衔接子连接到修复后cfDNA的两端；纯化，得到纯化产物；向包含前述纯化产物的反应体系内提供多对扩增引物对靶序列进行扩增，得到多重扩增产物；提供通用衔接子引物对，对所述多重扩增产物进行PCR反应，得到PCR产物，以获得测序文库。本发明还提供了一种细胞游离DNA的建库试剂盒。上述建库方法和建库试剂盒均能实现对cfDNA变异的高灵敏度和高准确度检测。

  发布时间：2023-09-24 07:20:46

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• 编码/解码基因组序列数据的方法、基因组编码器/解码器 公开日期：2023-09-19 公开号：CN110121577A 申请号：CN201780063014.X
  PCT发明 编码/解码基因组序列数据的方法、基因组编码器/解码器

  • 申请号：CN201780063014.X
  • 公开号：CN110121577A
  • 公开日期：2023-09-19
  • 申请人：基因组系统公司

  本公开涉及编码/解码基因组序列数据的方法、基因组编码器/解码器。当基因组测序机产生的基因组序列数据在一个或更多个参考序列上进行比对时，表示和处理该基因组序列数据的方法和装置。通过将读序相对于已有的或构造的参考序列进行比对来编码该读序。在比对之后，编码处理包括将读序分类成数据类，接着就描述符层的多重性对各个数据类进行编码。使用特定的源模型和熵编码器对用于表示各个数据类的描述符的子集进行编码。

  发布时间：2023-09-24 07:31:33

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• 一种DNA编码化合物库的液相色谱纯化方法 公开日期：2023-09-19 公开号：CN112575389A 申请号：CN201910943404.7
  发明 一种DNA编码化合物库的液相色谱纯化方法

  • 申请号：CN201910943404.7
  • 公开号：CN112575389A
  • 公开日期：2023-09-19
  • 申请人：成都先导药物开发股份有限公司

  本发明提供了一种用于DNA编码化合物库纯化的液相色谱纯化方法，所述方法为：取DNA编码化合物或其中间体，利用液相色谱柱进行洗脱，即可；其中，洗脱采用的流动相中，A相含有水、二异丙基乙胺、六氟异丙醇，B相含有甲醇。实验结果表明，本发明提供的液相纯化方法可以有效去除DNA编码化合物库合成过程中引入的单段DNA片段，还能够有效去除多个单段DNA片段相连生成的DNA片段杂质，能够显著提升DNA编码化合物库的最终产物纯度，并显著减少DNA片段的用量，降低生产成本，具有非常好的应用前景。

  发布时间：2023-06-02 13:41:43

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• 一种基因突变文库的合成方法及其应用 公开日期：2023-09-15 公开号：CN115852495A 申请号：CN202211729510.3
  发明 一种基因突变文库的合成方法及其应用

  • 申请号：CN202211729510.3
  • 公开号：CN115852495A
  • 公开日期：2023-09-15
  • 申请人：苏州泓迅生物科技股份有限公司

  本发明提供了一种基因突变文库的合成方法及其应用，所述方法包括：通过PCR反应将双链形式的目标DNA转换成含有dUTP的单链DNA；通过梯度降温式退火反应将Trimer引物连接至上述含有dUTP的单链DNA上，所述退火反应的程序为90‑95℃孵育5‑10min，以0.1‑0.2℃/s从90‑95℃降至20‑30℃，20‑30℃孵育30‑35min；退火后经过序列延伸、连接反应，形成Trimer结合下的双链杂合DNA突变序列集合；将所述集合经UDG酶消化，以消化产物为模板进行PCR扩增，获得目标基因特定区域多样化的突变序列集合；将所得序列集合与载体重组连接形成重组质粒，得到基因突变文库。

  发布时间：2023-09-18 07:38:26

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• 多特异性蛋白药物及其文库、以及制备方法和应用 公开日期：2023-09-15 公开号：CN110621814A 申请号：CN201880029385.0
  PCT发明 多特异性蛋白药物及其文库、以及制备方法和应用

  • 申请号：CN201880029385.0
  • 公开号：CN110621814A
  • 公开日期：2023-09-15
  • 申请人：安升（上海）医药科技有限公司

  提供了多特异性蛋白药物及其文库、以及制备方法和应用。具体地，提供了一种蛋白药物文库，所述蛋白药物文库包括C种不同的蛋白药物单体，其中，所述的蛋白药物单体包括蛋白药物元件部分以及与所述蛋白药物元件部分相连的核酸元件部分，并且一个所述蛋白药物单体的所述的核酸元件部分与至少一个不同的蛋白药物单体的核酸元件部分可通过互补形成双链配对结构，从而构成多聚体的蛋白药物；其中，C为≥2的正整数。

  发布时间：2023-09-18 07:36:35

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• 一种单链核酸分子高通量测序文库的构建方法及其应用 公开日期：2023-09-12 公开号：CN111979583A 申请号：CN202010949803.7
  发明 一种单链核酸分子高通量测序文库的构建方法及其应用

  • 申请号：CN202010949803.7
  • 公开号：CN111979583A
  • 公开日期：2023-09-12
  • 申请人：杭州求臻医学检验实验室有限公司

  本发明涉及生物测序领域，特别涉及一种单链核酸分子高通量测序文库的构建方法及其应用；包括以下步骤：从样品细胞中获取单链核酸；采用片段化试剂对长链的单链核酸样本片段化；在片段化单链核酸的3'末端加上基团A；加入5'端被基团B修饰且含有UMI分子标签的单链接头和盐离子缓冲液，在室温条件下，3'修饰基团A的片段化单链核酸与5'端修饰基团B单链接头发生加成反应且连接在一起；加入单向延伸引物1、单向延伸引物2和单链延伸试剂，用于由单链核酸变成双链核酸；加入测序引物和PCR混合液进行扩增，扩增产物即为测序文库。本发明的方法不仅适用于RNA样品，还适用于ssDNA，操作步骤简单，具有时间短、成本低、效率高的优势。

  发布时间：2023-09-14 07:27:55

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• 一种On-DNA芳基乙烯化合物与胺反应构建C-N键的方法 公开日期：2023-09-12 公开号：CN116732617A 申请号：CN202210206351.2
  发明 一种On-DNA芳基乙烯化合物与胺反应构建C-N键的方法

  • 申请号：CN202210206351.2
  • 公开号：CN116732617A
  • 公开日期：2023-09-12
  • 申请人：成都先导药物开发股份有限公司

  本发明涉及一种On‑DNA芳基乙烯化合物与胺反应构建C‑N键的方法。该方法以On‑DNA芳基乙烯化合物为原料，在钯催化剂、碱存在下通过共轭加成构建C‑N键。本发明提供的On‑DNA芳基乙烯化合物与胺反应的方法能够在有机溶剂/水相的混合水相中进行，后处理简单，条件温和，能够在较短时间内高收率得到高多样性的DNA编码化合物库，并且适用于多孔板进行的DNA编码化合物的合成。

  发布时间：2023-09-14 07:11:13

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• 针对生物大分子晶体中的小分子的阵列、浸泡溶液和选择浸泡条件的方法 公开日期：2023-09-12 公开号：CN116745472A 申请号：CN202180069782.2
  PCT发明 针对生物大分子晶体中的小分子的阵列、浸泡溶液和选择浸泡条件的方法

  • 申请号：CN202180069782.2
  • 公开号：CN116745472A
  • 公开日期：2023-09-12
  • 申请人：克里斯托斯福斯特有限公司

  本发明的主题是一种包括用于浸泡生物大分子晶体的浸泡溶液的阵列。此外，本发明的主题是一种选择具体浸泡溶液组成的基于规则的方法，所述具体浸泡溶液组成具有包括复合溶质(s)、水(w)、结晶溶液(crs)和/或有机溶剂(s)的具体组成。此外，本发明的主题是通过本发明方法获得的浸泡溶液和使用所述浸泡溶液的针对包括分子探针、片段和药物尺寸分子的小分子的筛选方法，以及所述浸泡溶液在对大分子晶体进行针对小分子的筛选方法中的用途。

  发布时间：2023-09-14 07:09:52

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