一种RNA-seq差异表达基因的判定方法及应用

专利内容

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114023385 A (43)申请公布日 2022.02.08 (21)申请号 202111272652.7 (22)申请日 2021.10.29 (71)申请人 浙江百麦生物科技有限公司 地址 313399 浙江省湖州市安吉县昌硕街 道安吉大道8号凤凰山西侧7幢2层228 室 (72)发明人 王蕊　 (74)专利代理机构 上海旭诚知识产权代理有限 公司 31220 代理人 郑立 (51)Int.Cl. G16B 25/10 (2019.01) 权利要求书1页 说明书3页 附图1页 (54)发明名称 一种RNA-seq差异表达基因的判定方法及应 用 (57)摘要 本发明公开了一种RNA‑seq差异表达基因的 判定方法及应用，涉及单细胞生物技术领域，该 判定方法包括步骤为：随机噪声干扰基因去除， 使用t‑test对每一个基因进行差异性检测以找 出非差异表达基因作为阴性对照，使用PLS对分 类相关分量进行建模，使用最小均方误差方法去 除分类无关分量，基于处理过的数据和非差异表 达基因找出离群值，判断为差异表达基因；该判 定方法在对比不同条件下的细胞表达谱特征的 区别的应用。本发明中判定标准的选择依靠数据 驱动的自适应算法，可以根据不同的数据自动调 A 整的，并不需要人为干预，从而降低了人为干预 5 误差。 8 3 3 2 0 4 1 1 N C CN 114023385