单细胞转录组数据预处理方法、电子设备及存储介质2025

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 116913389 A (43)申请公布日 2023.10.20 (21)申请号 202310673000.7 (22)申请日 2023.06.07 (71)申请人 金凤实验室 地址 401329 重庆市九龙坡区金玥路313号 金凤实验室 (72)发明人 王峥　 (74)专利代理机构 广州市华学知识产权代理有 限公司 44245 专利代理师 黄宗波 (51)Int.Cl. G16B 40/00 (2019.01) G16B 30/00 (2019.01) G06F 18/2413 (2023.01) G06F 18/2135 (2023.01) 权利要求书2页 说明书7页 附图2页 (54)发明名称 单细胞转录组数据预处理方法、电子设备及 存储介质 (57)摘要 本申请提供一种单细胞转录组数据预处理 方法、电子设备及存储介质。方法包括：获取用户 上传的基于单细胞组学产生的第一数据集；基于 过滤细胞的指标数据，对第一数据集进行过滤， 得到第二数据集，指标数据包括与UMI计数、特征 基因计数、线粒体基因百分比和β‑action表达 分别对应的阈值范围 ；调用批效应消除工具，对 第二数据集进行批效应消除 ，得到第三数据集； 通过DoubletFinder工具，对第三数据集进行双 胞剔除 ，得到经过预处理而得到的结果数据集。 本方案支持tsv、txt、csv、RDS及HDF5等多种格式 A 的数