基于互近邻的单细胞转录组批次矫正方法

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 116312792 A (43)申请公布日 2023.06.23 (21)申请号 202310372606.7 (22)申请日 2023.04.10 (71)申请人 西安电子科技大学 地址 710071 陕西省西安市雁塔区太白南 路2号 (72)发明人 高琳　梁涛　许晗　胡宇轩　 (74)专利代理机构 陕西电子工业专利中心 61205 专利代理师 王品华 (51)Int.Cl. G16B 30/00 (2019.01) G16B 40/00 (2019.01) G06N 3/0455 (2023.01) G06N 3/08 (2023.01) 权利要求书2页 说明书6页 附图3页 (54)发明名称 基于互近邻的单细胞转录组批次矫正方法 (57)摘要 本发明公开了一种基于互近邻单细胞转录 组批次矫正方法，主要解决现有基于互近邻批次 矫正方搜索到的MNN对数量少，矫正效果差的问 题。其实现方案为：对单细胞转录组数据的基因 特征进行筛选，筛选出高表达的基因 ；构建由编 码器和解码器组成的自编码器，使用单细胞转录 组数据筛选出高表达的基因对该编码器与解码 器进行交叉训练；使用训练好的自编码器提取单 细胞转录组数据筛选出高表达基因的特征，获得 单细胞低维嵌入无批次信息数据；在单细胞低维 嵌入无批次信息数据中搜索互近邻对，并利用其 计算出一个矫正向量；使用矫正向量对数据进行 A 批次矫正；本发明搜索