发明

基于生物信息的单核苷酸变异致病性分类方法及系统2025

2023-12-29 07:18:19 发布于四川 0
  • 申请专利号:CN202311082624.8
  • 公开(公告)日:2025-05-30
  • 公开(公告)号:CN117292753A
  • 申请人:山东建筑大学
摘要:本发明涉及基于生物信息的单核苷酸变异致病性分类方法及系统,包括以下步骤:获取每个DNA的多重序列比对,经预处理获得每个核苷酸的位置及每条核苷酸序列的重要性,将得到的重要性作为权重分配到对应的核苷酸序列上,形成输入矩阵;根据得到的输入矩阵对DNA序列采样,基于带有自注意力机制的变分自回归模型器,学习DNA序列的概率分布;根据得到的概率分布计算每个单核苷酸变异序列的进化指数,进化指数为单核苷酸变异序列与野生型序列的对数似然差异;将得到的进化指数拟合成为多个簇,分别对应单核苷酸变异序列的致病性概率,将单核苷酸变异序列的致病性概率划分为良性、可能良性、可能致病、致病和不确定意义五个类别。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 117292753 A (43)申请公布日 2023.12.26 (21)申请号 202311082624.8 (22)申请日 2023.08.24 (71)申请人 山东建筑大学 地址 250101 山东省济南市历城区临港开 发区凤鸣路1000号 (72)发明人 郝凡昌 柏苛  (74)专利代理机构 济南圣达知识产权代理有限 公司 37221 专利代理师 闫圣娟 (51)Int.Cl. G16B 30/10 (2019.01) G16B 40/00 (2019.01) G06F 18/2415 (2023.01) G06F 18/27 (2023.01) 权利要求书2页 说明书12页 附图3页 (54)发明名称 基于生物信息的单核苷酸变异致病性分类 方法及系统 (57)摘要 本发明涉及基于生物信息的单核苷酸变异 致病性分类方法及系统,包括以下步骤:获取每 个DNA的多重序列比对,经预处理获得每个核苷 酸的位置及每条核苷酸序列的重要性,将得到的 重要性作为权重分配到对应的核苷酸序列上,形 成输入矩阵;根据得到的输入矩阵对DNA序列采 样,基于带有自注意力机制的变分自回归模型 器,学习DNA序列的概率分布;根据得到的概率分 布计算每个单核苷酸变异序列的进化指数,进化 指数为单核苷酸变异序列与野生型序列的对数 似然差异;将得到的进化指数拟合成为多个簇, A 分别对应单核苷酸变异序列的致病性概率

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