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通过具有不定误差的读段的追踪重构

2023-06-04 11:26:55 发布于四川 1

申请专利号：CN201980054964.5
公开（公告）日：2025-06-06
公开（公告）号：CN112673431A
申请人：微软技术许可有限责任公司

摘要：多核苷酸测序生成多核苷酸分子的多个读段。读段中的许多或所有包含误差。追踪重构需要由多核苷酸测序仪生成的多个读段，并使用这些多个读段来准确地重构多核苷酸分子的核苷酸序列。一些读段可以包含无法被校正的误差。因此，可能存在可以在其整个长度上被使用的读段以及具有无法被校正的不定误差的其他读段。当不定误差被发现时，读段具有误差的部分被跳过，并且读段在误差之后的序列被用于重构追踪，而不是丢弃整个读段。跳过的读段的量由误差后与其他读段的共有序列相匹配的子序列的定位确定。分析在由匹配的定位确定的定位处继续。

专利内容

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 112673431 A (43)申请公布日 2021.04.16 (21)申请号 201980054964.5 (74)专利代理机构北京市金杜律师事务所 11256 (22)申请日 2019.06.24 代理人黄倩 (30)优先权数据 (51)Int.Cl. 16/105,349 2018.08.20 US G16B 30/10 (2006.01) (85)PCT国际申请进入国家阶段日 G16B 30/20 (2006.01) 2021.02.19 (86)PCT国际申请的申请数据 PCT/US2019/038628 2019.06.24 (87)PCT国际申请的公布数据 WO2020/040861 EN 2020.02.27 (71)申请人微软技术许可有限责任公司地址美国华盛顿州 (72)发明人 S ·M ·耶卡尼　M ·Z ·拉奇　

通过具有不定误差的读段的追踪重构

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