发明

一种基于序列统计表征学习的miRNA-mRNA靶标预测方法

2023-05-14 12:01:48 发布于四川 0
  • 申请专利号:CN202210337726.9
  • 公开(公告)日:2025-04-18
  • 公开(公告)号:CN114664376A
  • 申请人:重庆邮电大学
摘要:本发明涉及一种基于序列统计表征学习的miRNA‑mRNA靶标预测方法,属于生物信息学领域。采用神经网络和注意力机制结合的方式对miRNA和mRNA序列的结构特征进行多尺度,多粒度的特征提取,使得到特征即既含序列各个碱基字符和靶标区域序列的局部、全局的多尺度特征,又包含细粒度、粗粒度的多粒度语义信息特征联系。并使用变分自动编码器结构作整体框架,利用输入数据的概率分布保证预测的精确度,并增加了模型的可解释性。本发明采用基于序列统计表征学习的miRNA‑mRNA靶标预测方法能够有效地完成miRNA‑mRNA的靶标预测。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114664376 A (43)申请公布日 2022.06.24 (21)申请号 202210337726.9 G06N 3/08 (2006.01) (22)申请日 2022.03.31 (71)申请人 重庆邮电大学 地址 400065 重庆市南岸区黄桷垭崇文路2 号 (72)发明人 朱智勤 姚政 丛柏森 杨攀  李晓磊 李嫄源  (74)专利代理机构 北京同恒源知识产权代理有 限公司 11275 专利代理师 廖曦 (51)Int.Cl. G16B 20/30 (2019.01) G16B 30/00 (2019.01) G16B 40/00 (2019.01) G06N 3/04 (2006.01) 权利要求书4页 说明书6页 附图2页 (54)发明名称 一种基于序列统计表征学习的miRNA-mRNA 靶标预测方法 (57)摘要 本发明涉及一种基于序列统计表征学习的 miRNA‑mRNA靶标预测方法,属于生物信息学领 域。采用神经网络和注意力机制结合的方式对 miRNA和mRNA序列的结构特征进行多尺度,多粒 度的特征提取,使得到特征即既含序列各个碱基 字符和靶标区域序列的局部、全局的多尺度特 征,又包含细粒度、粗粒度的多粒度语义信息特 征联系。并使用变分自动编码器结构作整体框 架,利用输入数据的概率分布保证预

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