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一种蛋白质甲基化位点预测方法、装置及设备

2023-05-19 11:07:44 发布于四川 0
  • 申请专利号:CN202210468759.7
  • 公开(公告)日:2025-05-09
  • 公开(公告)号:CN114882952A
  • 申请人:深圳大学
摘要:本申请提供一种蛋白质甲基化位点预测方法、装置及设备,涉及生物信息技术领域,能够更准确地预测蛋白质甲基化位点,鲁棒性较高。该方法包括:获取待测蛋白质的三维结构数据,蛋白质由多个氨基酸组成;根据三维结构数据,构建以氨基酸为节点的图结构,图结构中每一个节点对应一个氨基酸;根据预设参数,从图结构中提取子图,预设参数包括子图跳数和距离阈值;将子图输入到训练好的图卷积神经网络中进行甲基化位点预测。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114882952 A (43)申请公布日 2022.08.09 (21)申请号 202210468759.7 (22)申请日 2022.04.29 (71)申请人 深圳大学 地址 518060 广东省深圳市南山区南海大 道3688号 (72)发明人 陈杰 李坚强 顾凌嫣 陈廷柏  梁中明  (74)专利代理机构 深圳中一联合知识产权代理 有限公司 44414 专利代理师 李木燕 (51)Int.Cl. G16B 40/00 (2019.01) G16B 30/00 (2019.01) G16B 15/20 (2019.01) 权利要求书2页 说明书11页 附图3页 (54)发明名称 一种蛋白质甲基化位点预测方法、装置及设 备 (57)摘要 本申请提供一种蛋白质甲基化位点预测方 法、装置及设备,涉及生物信息技术领域,能够更 准确地预测蛋白质甲基化位点,鲁棒性较高。该 方法包括:获取待测蛋白质的三维结构数据,蛋 白质由多个氨基酸组成;根据三维结构数据,构 建以氨基酸为节点的图结构,图结构中每一个节 点对应一个氨基酸;根据预设参数,从图结构中 提取子图,预设参数包括子图跳数和距离阈值; 将子图输入到训练好的图卷积神经网络中进行 甲基化位点预测。 A 2 5 9 2 8 8 4 1 1 N C CN 114882952 A 权 利 要

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