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发明

一种基于转录组数据的microRNA预测方法及系统2025

2023-12-17 07:17:05 发布于四川 0
  • 申请专利号：CN202311189496.7
  • 公开（公告）日：2025-05-23
  • 公开（公告）号：CN117198409A
  • 申请人：云南省农业科学院农业环境资源研究所
摘要：本发明涉及生物技术领域，尤其是一种基于转录数据的microRNA预测方法及系统，其中，所述基于转录组数据的microRNA预测方法，包括如下步骤：获取目标生物的转录组数据；利用所述非冗余蛋白数据库从转录组数据集中筛选出非蛋白编码序列；从所述非蛋白编码序列上滑动截取多个microRNA预测候选前体序列；利用现有microRNA成熟体序列筛选microRNA前体序列，并利用现有microRNA成熟体序列结合所述microRNA前体序列的二级结构，从microRNA前体序列筛选出所述目标生物在不同成长阶段的microRNA成熟序列。本发明利用转录组数据充分结合已知的蛋白编码序列和microRNA成熟体序列，实现了对目标生物在不同成长阶段的microRNA精准预测，为生物学研究和基因调控网络的探索提供了强大的工具。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 117198409 A (43)申请公布日 2023.12.08 (21)申请号 202311189496.7 G16B 20/00 (2019.01) (22)申请日 2023.09.15 (71)申请人 云南省农业科学院农业环境资源研 究所 地址 650205 云南省昆明市盘龙区北京路 2238号 (72)发明人 刘莹　谌爱东　胡文斌　尹艳琼　 赵雪晴　李向永　陈福寿　张红梅　 王燕　 (74)专利代理机构 重庆律知诚专利代理事务所 (普通合伙) 50281 专利代理师 柘涛 (51)Int.Cl. G16B 50/00 (2019.01) G16B 40/00 (2019.01) 权利要求书2页 说明书9页 附图1页 (54)发明名称 一种基于转录组数据的microRNA预测方法 及系统 (57)摘要 本发明涉及生物技术领域，尤其是一种基于 转录数据的microRNA预测方法及系统，其中，所 述基于转录组数据的microRNA预测方法，包括如 下步骤：获取目标生物的转录组数据；利用所述 非冗余蛋白数据库从转录组数据集中筛选出非 蛋白编码序列；从所述非蛋白编码序列上滑动截 取多个microRNA预测候选前体序列；利用现有 microRNA成熟体序列筛选microRNA前体序列，并 利用

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