发明

对被污染样品进行亲子鉴定的生物信息处理方法

2023-04-22 09:17:04 发布于四川 1
  • 申请专利号:CN202111056059.9
  • 公开(公告)日:2024-09-10
  • 公开(公告)号:CN113930492A
  • 申请人:武汉蓝沙医学检验实验室有限公司
摘要:本发明公开了一种对被污染样品进行亲子鉴定的生物信息处理方法,属于生物信息技术领域。包括:(1)获取待亲子鉴定的两个样本的测序数据,测序数据为采用二代测序技术得到;(2)判断一个样本是否被另一个样本污染,如果是,则对未被污染的样品进行分型得到得到纯合子数M和杂合子数N;(3)以M为基数,对被污染的样品中对应点位进行分型并得到杂合比值f;(4)根据M计算得到符合亲子关系的理论杂合率F0和不符合亲子关系的理论杂合率F1;(5)根据统计学算法判断f与F0和F1的偏离程度;如果f与F0无显著差异且f与F1有显著差异,则两个样本为亲子关系;如果f与F0显著差异且f与F1无显著差异,则两个样本为非亲子关系。

专利内容

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113930492 A (43)申请公布日 2022.01.14 (21)申请号 202111056059.9 (22)申请日 2021.09.09 (71)申请人 武汉蓝沙医学检验实验室有限公司 地址 430000 湖北省武汉市硚口区工农路6 号公共卫生服务大楼11-12层 (72)发明人 杨功达 曾丰波 巫萍 胡秀娣  黄奎匀  (74)专利代理机构 武汉惠创知识产权代理事务 所(普通合伙) 42243 代理人 童思明 (51)Int.Cl. C12Q 1/6874 (2018.01) C12Q 1/6888 (2018.01) G16B 20/20 (2019.01) 权利要求书2页 说明书7页 附图2页 (54)发明名称 对被污染样品进行亲子鉴定的生物信息处 理方法 (57)摘要 本发明公开了一种对被污染样品进行亲子 鉴定的生物信息处理方法,属于生物信息技术领 域。包括:(1)获取待亲子鉴定的两个样本的测序 数据,测序数据为采用二代测序技术得到;(2)判 断一个样本是否被另一个样本污染,如果是,则 对未被污染的样品进行分型得到得到纯合子数M 和杂合子数N;(3)以M为基数,对被污染的样品中 对应点位进行分型并得到杂合比值f;(4)根据M 计算得到符合亲子关系的理论杂合率F0和不符 合亲子关系的理论杂合率F1;(5)根据统计学算 法判断f与F0和F1的偏离程度;如果

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