热点残基和靶点蛋白复合物结构的生成方法及装置

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(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114927160 A (43)申请公布日 2022.08.19 (21)申请号 202210616239.6 (22)申请日 2022.03.03 (62)分案原申请数据 202210203337.7 2022.03.03 (71)申请人 北京晶泰科技有限公司 地址 100083 北京市海淀区中关村东路8号 东升大厦AB座七层706单元 (72)发明人 王天元　吴炜坤　 (74)专利代理机构 北京汇鑫君达知识产权代理 有限公司 11769 专利代理师 刘湘菲 (51)Int.Cl. G16B 15/00 (2019.01) G16B 35/00 (2019.01) 权利要求书2页 说明书16页 附图4页 (54)发明名称 热点残基和靶点蛋白复合物结构的生成方 法及装置 (57)摘要 本申请涉及一种热点残基和靶点蛋白复合 物结构的生成方法及装置。该方法包括：将丙氨 酸的原子坐标调整至靶点蛋白的特定表位区域 后，在丙氨酸的两端分别延伸一个甘氨酸，形成 初始三肽结构；将初始三肽结构中的丙氨酸分别 突变为天然氨基酸或D型构象的天然氨基酸，获 得对应的突变三肽结构；根据第一预设打分函数 对突变三肽结构的骨架二面角随机赋值，获得对 应的打分值并筛选获得候选三肽构象；候选三肽 构象在靶点蛋白的特定表位区域中的局部区域 进行分子对接，获得候选三肽与靶点蛋白的结合 A 构象，并筛选获得结合自由能最低的优选三肽与 0 靶