发明

一种基于图表示学习的关键蛋白质识别方法和装置

2023-05-14 11:56:47 发布于四川 0
  • 申请专利号:CN202210182217.3
  • 公开(公告)日:2024-09-06
  • 公开(公告)号:CN114664377A
  • 申请人:中国地质大学(武汉)
摘要:本发明提供了一种基于图表示学习的关键蛋白质识别方法和装置,方法包括:从数据库中筛选关键蛋白质作为标签,标记提取的蛋白质相互作用网络数据中的蛋白质节点,获得带节点标签的蛋白质相互作用网络;使用DeepWalk算法对蛋白质相互作用网络数据进行图表示学习,获得图表示矩阵数据;将带节点标签的蛋白质相互作用网络、从蛋白质节点的同源生物信息中提取的蛋白质节点属性特征以及图表示矩阵数据输入图卷积神经网络模型进行迭代训练;利用训练好的图卷积神经网络模型识别待测蛋白质网络中的关键蛋白质节点。本发明可以直接使用图类型数据进行训练,避免了现有方法中数据转换所需要的繁琐工作,进一步使得训练得到的结果更加准确。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114664377 A (43)申请公布日 2022.06.24 (21)申请号 202210182217.3 (22)申请日 2022.02.25 (71)申请人 中国地质大学(武汉) 地址 430000 湖北省武汉市洪山区鲁磨路 388号 (72)发明人 杨合 朱媛  (51)Int.Cl. G16B 25/10 (2019.01) G06N 3/04 (2006.01) G06N 3/08 (2006.01) 权利要求书1页 说明书8页 附图3页 (54)发明名称 一种基于图表示学习的关键蛋白质识别方 法和装置 (57)摘要 本发明提供了一种基于图表示学习的关键 蛋白质识别方法和装置,方法包括:从数据库中 筛选关键蛋白质作为标签,标记提取的蛋白质相 互作用网络数据中的蛋白质节点,获得带节点标 签的蛋白质相互作用网络;使用DeepWalk算法对 蛋白质相互作用网络数据进行图表示学习,获得 图表示矩阵数据;将带节点标签的蛋白质相互作 用网络、从蛋白质节点的同源生物信息中提取的 蛋白质节点属性特征以及图表示矩阵数据输入 图卷积神经网络模型进行迭代训练;利用训练好 的图卷积神经网络模型识别待测蛋白质网络中 A 的关键蛋白质节点。本发明可以直接使用图类型 7 数据进行训练,避免了现有方法中数据转换所需 7 3 4 要的繁琐工作,进一步使得训练得到的结果更加 6 6 4 准确。 1 1 N C CN 114664377 A

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