发明

一种基于基因共表达网络的分类特征确定方法及系统2024

2024-04-21 07:52:47 发布于四川 0
  • 申请专利号:CN202410313618.7
  • 公开(公告)日:2024-04-19
  • 公开(公告)号:CN117912570A
  • 申请人:北京科技大学
摘要:本发明提供一种基于基因共表达网络的分类特征确定方法及系统,涉及数据处理技术领域,方法包括:获取样本数据;提取样本数据的基因特征;分析确定出正常组与癌症组之间具有差异性的基因特征;计算基因特征之间的相关性;通过马尔可夫毯滤波算法,对基因特征进行冗余特征消除,得到最优特征集合;构建加权基因共表达网络;确定枢纽基因;对枢纽基因进行聚类分析,并对各类基因模块中的基因特征的表达量进行汇总,得到模块特征基因;对枢纽基因、模块特征基因、癌症组织浸润微生物含量以及免疫细胞含量进行特征组合,得到多种组合特征;通过逻辑回归模型,基于各种组合特征对样本数据进行分类;基于分类结果,确定分类效果最佳的组合特征。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 117912570 A (43)申请公布日 2024.04.19 (21)申请号 202410313618.7 (22)申请日 2024.03.19 (71)申请人 北京科技大学 地址 100083 北京市海淀区学院路30号 (72)发明人 艾冬梅 张天鹏 张林桐 杜洋  李雨珈 邢永莲  (74)专利代理机构 北京市广友专利事务所有限 责任公司 11237 专利代理师 张仲波 闫美玉 (51)Int.Cl. G16B 40/20 (2019.01) G16B 40/30 (2019.01) G16B 25/10 (2019.01) 权利要求书3页 说明书13页 附图2页 (54)发明名称 一种基于基因共表达网络的分类特征确定 方法及系统 (57)摘要 本发明提供一种基于基因共表达网络的分 类特征确定方法及系统,涉及数据处理技术领 域,方法包括:获取样本数据;提取样本数据的基 因特征;分析确定出正常组与癌症组之间具有差 异性的基因特征;计算基因特征之间的相关性; 通过马尔可夫毯滤波算法,对基因特征进行冗余 特征消除,得到最优特征集合;构建加权基因共 表达网络;确定枢纽基因;对枢纽基因进行聚类 分析,并对各类基因模块中的基因特征的表达量 进行汇总,得到模块特征基因;对枢纽基因、模块 特征基因、癌症组织浸润微生物含量以及免疫细 A 胞含量进行特征组合,得到多种组合特征;通过 0 逻辑回归模型,

最新专利