PCT发明

用于散列表基因组映射的灵活种子延伸

2023-07-06 10:54:43 发布于四川 0
  • 申请专利号:CN202080003658.1
  • 公开(公告)日:2024-12-17
  • 公开(公告)号:CN113826168A
  • 申请人:伊鲁米那股份有限公司
摘要:本发明公开了用于生成和使用被配置为改进读段映射的散列表的方法、系统和装置,包括计算机程序,该方法、系统和装置包括:从参考序列获得K个核苷酸的第一种子,生成具有节点的种子延伸树,其中该节点中的每个节点对应于(i)延伸种子,该延伸种子是第一种子的延伸并具有K*的核苷酸长度,和(ii)种子延伸表中的一个或多个位置,该一个或多个位置包括描述与该延伸种子匹配的参考序列位置的数据,并且对于每个节点:在该散列表的对应于延伸种子的索引键的位置存储区间信息,其中该区间信息引用该种子延伸表中的一个或多个位置,该一个或多个位置包括与和该节点相关联的该延伸种子匹配的参考序列位置。

专利内容

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113826168 A (43)申请公布日 2021.12.21 (21)申请号 202080003658.1 (74)专利代理机构 广州三环专利商标代理有限 公司 44202 (22)申请日 2020.05.22 代理人 郝传鑫 (30)优先权数据 (51)Int.Cl. 62/852,965 2019.05.24 US G16B 30/10 (2019.01) (85)PCT国际申请进入国家阶段日 G16B 20/30 (2019.01) 2020.12.25 (86)PCT国际申请的申请数据 PCT/US2020/034395 2020.05.22 (87)PCT国际申请的公布数据 WO2020/243009 EN 2020.12.03 (71)申请人 伊鲁米那股份有限公司 地址 美国加利福尼亚州 (72)发明人 迈克尔 ·吕勒  权利要求书12页 说明书36页

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