一种在线整合多来源单细胞数据的方法和系统

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(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114038505 A (43)申请公布日 2022.02.11 (21)申请号 202111213929.9 (22)申请日 2021.10.19 (71)申请人 清华大学 地址 100084 北京市海淀区清华大学 (72)发明人 张强锋　熊磊　 (74)专利代理机构 北京知联天下知识产权代理 事务所(普通合伙) 11594 代理人 张迎新 (51)Int.Cl. G16B 40/00 (2019.01) 权利要求书2页 说明书8页 附图1页 (54)发明名称 一种在线整合多来源单细胞数据的方法和 系统 (57)摘要 本发明公开了一种在线整合多来源单细胞 数据的方法，该方法包括：输入多个不同来源的 具有批次效应的单细胞数据；通过批次效应无关 的编码器将所述单细胞数据投射到与批次效应 无关的、泛化的仅保留生物学信息的单细胞空 间；将不同来源的相同类型的细胞在所述单细胞 空间对齐，不同类型的细胞分别各自进行定位， 彼此分开；通过特异性解码器将特定批次变量信 息加入到单细胞空间的各单细胞信息，以重建单 细胞数据；本发明实现了与批次无关的单细胞数 据整合，具有非常好的泛化性特性，模型训练后 A 对数据能够很好的拟合(align to)，对新的批次 5 的数据也能很好的拟合，能够不断整合新产生的 0 5 8 数据，实现在线整合(online  integrate)功能。 3 0 4 1 1 N C CN 114038505