发明

一种基于最小熵算法的基因表达网络分析方法2025

2023-10-16 07:27:35 发布于四川 0
  • 申请专利号:CN202310912377.3
  • 公开(公告)日:2025-07-15
  • 公开(公告)号:CN116884487A
  • 申请人:海南大学
摘要:本发明提供一种基于最小熵算法的基因表达网络分析方法,包括以下步骤:数据收集及预处理;基因间相关性获取;转换数据格式;基于基因相关性矩阵建立基因表达网络;使用Infomap多级网络聚类模型对基因表达网络进行聚类,利用随机游走的方式识别所有基因之间的关系,将同信息编码的基因划分为同一个群组,并对得到的每一个群组进行网络可视化。本申请基于最小熵算法选择相关性强的基因来构建基因表达网络,解决以往技术无法直接从计算过程中选择相关性强的基因去绘制表达网络的问题,并基于评估最小熵算法每个基因对于聚类任务的重要性,并选择最具代表性的基因作为聚类特征,提升聚类结果的准确性。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 116884487 A (43)申请公布日 2023.10.13 (21)申请号 202310912377.3 (22)申请日 2023.07.24 (71)申请人 海南大学 地址 570228 海南省海口市美兰区人民大 道58号 (72)发明人 夏志强 江思容 邹枚伶  (74)专利代理机构 广州三环专利商标代理有限 公司 44202 专利代理师 文小花 (51)Int.Cl. G16B 25/00 (2019.01) G16B 40/00 (2019.01) G16B 45/00 (2019.01) G06F 18/2321 (2023.01) 权利要求书2页 说明书4页 附图5页 (54)发明名称 一种基于最小熵算法的基因表达网络分析 方法 (57)摘要 本发明提供一种基于最小熵算法的基因表 达网络分析方法,包括以下步骤:数据收集及预 处理;基因间相关性获取;转换数据格式;基于基 因相关性矩阵建立基因表达网络;使用Infomap 多级网络聚类模型对基因表达网络进行聚类,利 用随机游走的方式识别所有基因之间的关系,将 同信息编码的基因划分为同一个群组,并对得到 的每一个群组进行网络可视化。本申请基于最小 熵算法选择相关性强的基因来构建基因表达网 络,解决以往技术无法直接从计算过程中选择相 关性强的基因去绘制表达网络的问题,并基于评 A 估最小熵算法每个基因对于聚类任务的重要性,

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