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基于Hi-C测序数据的TAD识别方法及系统2024

2024-04-21 07:55:28 发布于四川 1
  • 申请专利号:CN202210512716.4
  • 公开(公告)日:2024-04-19
  • 公开(公告)号:CN114944190A
  • 申请人:南开大学
摘要:本发明公开了基于Hi‑C测序数据的TAD识别方法及系统;其中,所述方法包括:获取单条染色体的Hi‑C测序数据;对单条染色体的Hi‑C测序数据进行分段,生成若干个染色体片段;对每个染色体片段进行TAD结构识别;根据识别的TAD结构,识别假阳性结果。充分利用了整条染色体Hi‑C测序数据,提高了精度;同时引入随机重启游走算法和惩罚操作,通过惩罚系数有效的限制了基因变异带来的影响。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114944190 A (43)申请公布日 2022.08.26 (21)申请号 202210512716.4 (22)申请日 2022.05.12 (71)申请人 南开大学 地址 300071 天津市津南区海河教育园区 同砚路38号 (72)发明人 刘健 李平静 陈娇  (74)专利代理机构 济南圣达知识产权代理有限 公司 37221 专利代理师 黄海丽 (51)Int.Cl. G16B 15/20 (2019.01) G16B 30/00 (2019.01) 权利要求书2页 说明书6页 附图1页 (54)发明名称 基于Hi-C测序数据的TAD识别方法及系统 (57)摘要 本发明公开了基于Hi‑C测序数据的TAD识别 方法及系统;其中,所述方法包括:获取单条染色 体的Hi‑C测序数据;对单条染色体的Hi‑C测序数 据进行分段,生成若干个染色体片段;对每个染 色体片段进行TAD结构识别;根据识别的TAD结 构,识别假阳性结果。充分利用了整条染色体Hi‑ C测序数据,提高了精度;同时引入随机重启游走 算法和惩罚操作,通过惩罚系数有效的限制了基 因变异带来的影响。 A 0 9 1 4 4 9 4 1 1 N C CN 114944190 A 权 利 要 求 书 1/2页 1.基于Hi‑C测序数据的TAD识别方

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