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发明

一种保加利亚乳杆菌与嗜热链球菌相互作用预测方法

2023-08-10 07:00:04 发布于四川 7
  • 申请专利号：CN202210671757.8
  • 公开（公告）日：2023-08-08
  • 公开（公告）号：CN114999586A
  • 申请人：内蒙古农业大学
摘要：本发明公开了一种保加利亚乳杆菌与嗜热链球菌相互作用预测方法，步骤如下：S1、数据预处理和特征提取；S2、确定标签；S3、模型的构建与评估，对步骤S2中的正负样本数据集采用机器学习、深度学习方法进行模型构建并对剩余的经过实验验证的50％的互作对和50％的不互作对采用评估指标进行评估；S4、模型的调优；S5、取m株保加利亚乳杆菌和n株嗜热链球菌的代谢通路图特征矩阵，通过对特征矩阵中相同的酶取交集并相加得到融合特征向量，通过降维方法对融合特征向量降维，重复S2到S4。S6、取S4和S5中评估结果较优的模型。本发明采用上述一种保加利亚乳杆菌与嗜热链球菌相互作用预测方法，采用特征提取、聚类、机器学习与深度学习技术，加快了检测速度。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114999586 A (43)申请公布日 2022.09.02 (21)申请号 202210671757.8 (22)申请日 2022.06.14 (71)申请人 内蒙古农业大学 地址 010018 内蒙古自治区呼和浩特市鄂 尔多斯大街内蒙古农业大学新校区 (72)发明人 孙志宏　董改芳　赵洁　白梅　 (74)专利代理机构 北京圣州专利代理事务所 (普通合伙) 11818 专利代理师 李春 (51)Int.Cl. G16C 20/30 (2019.01) G06N 20/00 (2019.01) G06N 3/04 (2006.01) G06K 9/62 (2022.01) 权利要求书2页 说明书4页 (54)发明名称 一种保加利亚乳杆菌与嗜热链球菌相互作 用预测方法 (57)摘要 本发明公开了一种保加利亚乳杆菌与嗜热 链球菌相互作用预测方法，步骤如下：S1、数据预 处理和特征提取；S2、确定标签；S3、模型的构建 与评估，对步骤S2中的正负样本数据集采用机器 学习、深度学习方法进行模型构建并对剩余的经 过实验验证的50％的互作对和50％的不互作对 采用评估指标进行评估；S4、模型的调优；S5、取m 株保加利亚乳杆菌和n株嗜热链球菌的代谢通路 图特征矩阵，通过对特征矩阵中相同的酶取交集 并相加得到融合特征向量，通过降维方法对融合 特征向量降维，重复S2到S4。S6、取S4和S5中评估 A

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