基于空间转录组学数据特征提取的空间域识别方法

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 116189785 A (43)申请公布日 2023.05.30 (21)申请号 202310097081.0 (22)申请日 2023.02.10 (71)申请人 西安电子科技大学 地址 710071 陕西省西安市太白南路2号 (72)发明人 贾松卫　崔议文　兰猛　 (74)专利代理机构 陕西电子工业专利中心 61205 专利代理师 王品华 (51)Int.Cl. G16B 40/20 (2019.01) G16B 25/00 (2019.01) G06F 18/2135 (2023.01) G06F 18/23 (2023.01) 权利要求书6页 说明书11页 附图2页 (54)发明名称 基于空间转录组学数据特征提取的空间域 识别方法 (57)摘要 本发明公开了一种基于空间转录组学数据 特征提取的空间域识别方法，主要解决现有技术 对空间转录组数据特征提取存在过拟合及空间 域识别精度低的问题。其实现方案为：对空间转 录组中测量得到的基因表达数据和空间信息进 行预处理；基于基因表达特征矩阵和空间信息构 建基因相似性网络和空间邻域网络；对基因相似 性网络和空间邻域网络进行数据增强；构建特征 提取模型，并将增强的数据输入到模型中计算对 比损失和重构损失 ；依据计算损失训练模型，将 未增强的数据输入到训练好的模型中得到低维 A 嵌入；对低维嵌入进行聚类完成对空间域识别。 5 本发明避免了在特征提取过程中的