发明

快速筛选小鼠mmu-miR-25-3p与启动子结合靶点的方法

2023-05-12 11:39:32 发布于四川 2
  • 申请专利号:CN202210261235.0
  • 公开(公告)日:2023-05-30
  • 公开(公告)号:CN114550821A
  • 申请人:皖南医学院第一附属医院(皖南医学院弋矶山医院)
摘要:本发明公开一种快速筛选小鼠mmu‑miR‑25‑3p与启动子结合靶点的方法,包括如下步骤:下载小鼠最新基因组序列和对应的注释文件,以及小鼠mmu‑miR‑25‑3p序列文件;从下载的小鼠最新基因组序列中提取小鼠最新基因组序列的染色体长度,并由此从小鼠最新基因组序列和对应的注释文件中提取启动子的序列;通过seedVicious软件筛选小鼠mmu‑miR‑25‑3p序列与S2提取的启动子序列,保留与miRNA种子序列完全匹配靶标的种类,获得mmu‑miR‑25‑3p与启动子靶标的预测结果。本发明利用现有数据和软件,在计算机上实现快速对小鼠mmu‑miR‑25‑3p与启动子结合靶点的筛选。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114550821 A (43)申请公布日 2022.05.27 (21)申请号 202210261235.0 (22)申请日 2022.03.16 (71)申请人 皖南医学院第一附属医院(皖南医 学院弋矶山医院) 地址 241000 安徽省芜湖市赭山西路2号 (72)发明人 蒋澜 王祖贞 吕坤 童九翠  杨建课 冯翔 邓汉诺 罗天乐  汪乐瑶 杜金锐  (74)专利代理机构 南京业腾知识产权代理事务 所(特殊普通合伙) 32321 专利代理师 马静静 (51)Int.Cl. G16B 20/30 (2019.01) 权利要求书1页 说明书4页 (54)发明名称 快速筛选小鼠mmu-miR-25-3p与启动子结合 靶点的方法 (57)摘要 本发明公开一种快速筛选小鼠mmu‑miR‑25‑ 3p与启动子结合靶点的方法,包括如下步骤:下 载小鼠最新基因组序列和对应的注释文件,以及 小鼠mmu‑miR‑25‑3p序列文件;从下载的小鼠最 新基因组序列中提取小鼠最新基因组序列的染 色体长度,并由此从小鼠最新基因组序列和对应 的 注 释 文 件中 提 取 启动子的 序 列 ;通 过 seedVicious软件筛选小鼠mmu‑miR‑25‑3p序列 与S2提取的启动子序列,保留与miRNA种子序列 完全匹配靶标的种类,获得mmu‑miR‑25‑3p与启 动子靶标的预测结果。本发明利用现有数据和

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