发明

一种基于相似性和张量分解的微生物-疾病关联关系预测方法

2023-05-12 11:54:41 发布于四川 0
  • 申请专利号:CN202210206471.2
  • 公开(公告)日:2024-09-27
  • 公开(公告)号:CN114582526A
  • 申请人:湖南中医药大学
摘要:本发明公开了一种基于相似性和张量分解的微生物‑疾病关联关系预测方法,包括以下步骤:步骤S1,构建疾病功能相似性矩阵Dfunsim和疾病表征相似性矩阵Dsymsim,并对所述疾病功能相似性矩阵Dfunsim和所述疾病表征相似性矩阵Dsymsim进行均值集成得到最终的疾病相似性矩阵Sd;步骤S2,根据微生物的序列信息得到微生物的序列相似性Sm;步骤S3,利用已知的微生物‑疾病关联关系和关联类型构建一个微生物疾病关联的三维二进制关联矩阵;步骤S4,利用微生物相似性、疾病相似性和微生物疾病关联的三维二进制关联矩阵采用张量分解的模型对微生物‑疾病的深层次关联关系进行预测。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114582526 A (43)申请公布日 2022.06.03 (21)申请号 202210206471.2 (22)申请日 2022.03.03 (71)申请人 湖南中医药大学 地址 410208 湖南省长沙市岳麓区含浦科 教园象嘴路1号湖南中医药大学 (72)发明人 严承 黄辛迪 刘佳俊  (74)专利代理机构 长沙瀚顿知识产权代理事务 所(普通合伙) 43223 专利代理师 吴亮 (51)Int.Cl. G16H 70/60 (2018.01) G06K 9/62 (2022.01) G06F 17/16 (2006.01) 权利要求书3页 说明书9页 附图1页 (54)发明名称 一种基于相似性和张量分解的微生物-疾病 关联关系预测方法 (57)摘要 本发明公开了一种基于相似性和张量分解 的微生物‑疾病关联关系预测方法,包括以下步 骤:步骤S1,构建疾病功能相似性矩阵Dfunsim和疾 病表征相似性矩阵Dsymsim ,并对所述疾病功能相 似性矩阵Dfunsim 和所述疾病表征相似性矩阵 Dsymsim进行均值集成得到最终的疾病相似性矩阵 d S ;步骤S2,根据微生物的序列信息得到微生物 m 的序列相似性S ;步骤S3,利用已知的微生物‑疾 病关联关系和关联类型构建一个微生物疾病关 联的三维二进制关联矩阵;步骤S4,利用微生物 相似性、疾病相似性和微生物疾病关联的

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