病毒进化趋势预测方法和系统2025

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 117174163 A (43)申请公布日 2023.12.05 (21)申请号 202311102542.5 (22)申请日 2023.08.29 (71)申请人 上海交通大学 地址 200240 上海市闵行区东川路800号 (72)发明人 马步勇　曾鑫成　邱毓淞　宁振宇　 张凌昊　李香逸　吕利君　董若冰　 许晗琳　王艳菁　 (74)专利代理机构 上海段和段律师事务所 31334 专利代理师 王丹东 (51)Int.Cl. G16B 15/30 (2019.01) G16B 45/00 (2019.01) G06N 3/0455 (2023.01) G06N 3/08 (2023.01) 权利要求书3页 说明书8页 附图1页 (54)发明名称 病毒进化趋势预测方法和系统 (57)摘要 本发明提供了一种病毒进化趋势预测方法 和系统，包括：获取有基于深度突变扫描的亲和 力标注的病毒蛋白‑靶点蛋白对，划分为训练集、 验证集和测试集；搭建数据编码器，对蛋白质语 言模型进行数据编码；对数据编码器中的蛋白质 语言模型在下游任务上进行逐层参数训练；在训 练集和验证集上对预测亲和力和实验亲和力两 个指标以相关系数R2进行评价，选出最优模型， 最终在测试集上进行预测验证；计算基于结构的 免疫逃逸分数和基于语言模型的免疫逃逸分数； 进行病毒适应性计算以及遗传变异