基于通路活性及弹性网的癌症药物敏感性预测方法

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(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 112599207 A (43)申请公布日 2021.04.02 (21)申请号 202011539984.2 (22)申请日 2020.12.23 (71)申请人 上海海洋大学 地址 201306 上海市浦东新区沪城环路999 号 (72)发明人 秦玉芳　高冲　陈明　宋春晖　 孙浩　 (74)专利代理机构 上海伯瑞杰知识产权代理有 限公司 31227 代理人 范艳静 (51)Int.Cl. G16C 20/30 (2019.01) G16C 20/70 (2019.01) 权利要求书1页 说明书4页 附图3页 (54)发明名称 基于通路活性及弹性网的癌症药物敏感性 预测方法 (57)摘要 本发明提供了一种基于通路活性及弹性网 的癌症药物敏感性预测方法，首先，在基因表达 矩阵中，选择每一个通路网络中和其他基因连接 紧密的关键基因表达值并计算分析，得到每一个 通路活性向量，然后把所有的通路活性向量合并 为矩阵；把每个药物的分子描述作为该药物化学 特征矩阵和通路活性特征矩阵合并成新的特征 矩阵；最后，使用弹性网对24种药物的特征矩阵 进行训练并优化参数，使用均方误差作为评价标 准；发明能够有效预测出每种药物的敏感性水平 和其生物标志物，在大多数药物上具有更高的精 A 度，可以帮助临床实验减少时间和金钱成本，从 7 而进行有效的预测药物反应；本发明的方法能够 0 2 9 从多