基于图神经网络表征的蛋白质与核酸结合位点预测方法

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(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114765063 A (43)申请公布日 2022.07.19 (21)申请号 202110037110.5 (22)申请日 2021.01.12 (71)申请人 上海交通大学 地址 200240 上海市闵行区东川路800号 (72)发明人 夏莹　沈红斌　潘小勇　夏春秋　 (74)专利代理机构 上海交达专利事务所 31201 专利代理师 王毓理　王锡麟 (51)Int.Cl. G16B 20/30 (2019.01) 权利要求书3页 说明书7页 附图3页 (54)发明名称 基于图神经网络表征的蛋白质与核酸结合 位点预测方法 (57)摘要 一种基于图神经网络表征的蛋白质与核酸 结合位点预测方法，通过构建蛋白质与核酸相互 作用数据集，经样本融合处理后提取其中蛋白质 中每个残基的位置和特征信息及其结构上下文， 并据此构建残基结构上下文的图表示，通过层次 图神经网络对待预测的蛋白质的图表示进行预 测，得到每个残基与DNA/RNA结合的概率，实现蛋 白质与核酸结合位点预测。本发明通过基于结构 上下文的残基的图表示和层次图神经网络模型 来从图表示中学习结合位点的关键结构和特征 模式。 A 3 6 0 5 6 7 4 1 1 N C CN 114765063 A 权　利　要　求　书 1/3页 1.一种基于图神经网络表征的蛋白质与核酸结合位点预测方法，其特征在于，通过构