基于深度稀疏表示网络的DNA结合蛋白识别方法

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(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114863998 A (43)申请公布日 2022.08.05 (21)申请号 202210362641.6 (22)申请日 2022.04.08 (71)申请人 苏州科技大学 地址 215004 江苏省苏州市虎丘区学府路 99号 (72)发明人 钱昱磬　丁漪杰　吴宏杰　 (74)专利代理机构 苏州科仁专利代理事务所 (特殊普通合伙) 32301 专利代理师 郭杨 (51)Int.Cl. G16B 20/00 (2019.01) 权利要求书2页 说明书4页 附图2页 (54)发明名称 基于深度稀疏表示网络的DNA结合蛋白识别 方法 (57)摘要 一种基于深度稀疏表示网络的DNA结合蛋白 识别方法,包括以下具体步骤：获取DNA结合蛋白 序列数据集，分为训练集和测试集；采用PSL‑ BLAST软件计算DNA结合蛋白序列数据集内所有 序列的特异性打分矩阵；将所有的特异性打分矩 阵分别填充或裁剪成相同尺寸的新特异性打分 矩阵；采用深度稀疏表示网络构建并训练DNA结 合蛋白识别分类器模型，将新特异性打分矩阵输 入DNA结合蛋白识别分类器模型内，完成对DNA结 合蛋白序列的识别。构建并训练出的DNA结合蛋 白识别分类器模型是一种端到端的网络，能够明 A 显的提高预测精度，误差较小，采用卷积自编码 8 器可以鲁棒地学习特异性打分矩阵的潜在特征， 9 9 3 并通过稀疏表示层进行分类，提高了模型的泛化 6 8 4 能力。 1 1