发明

一种基于集成多组学分析预测QTL内候选基因的方法和系统

2023-05-09 09:45:18 发布于四川 0
  • 申请专利号:CN202111627739.1
  • 公开(公告)日:2024-09-13
  • 公开(公告)号:CN114360648A
  • 申请人:武汉大学
摘要:本发明公开了一种基于集成多组学分析预测QTL内候选基因的方法和系统,所述方法包括:选取母本和父本,将所述母本和父本杂交获得F1代,单粒传种构建出重组自交系RILs;将所述重组自交系RILs进行测序并构建遗传图谱,并进行QTL分析,获得QTL区间及QTLs区间位置信息;于公开数据库搜集目标性状相关的已知基因,并与所述QTLs区间位置信息进行比较,获得候选基因;将所述候选基因与父母本蛋白序列库进行比对,获得存在差异的基因;后基因分型,获取各分型群对应的性状并进行检验;对所述存在差异的基因进行公共表达数据库佐证和转基因验证,获得QTL内候选基因。该方法集成多组学分析方法能有效锁定候选基因,操作便捷。

专利内容

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114360648 A (43)申请公布日 2022.04.15 (21)申请号 202111627739.1 (22)申请日 2021.12.28 (71)申请人 武汉大学 地址 430072 湖北省武汉市武昌区珞珈山 武汉大学 (72)发明人 孔维龙 李阳生 邓霄霄 张晨浩  周明骜  (74)专利代理机构 武汉科皓知识产权代理事务 所(特殊普通合伙) 42222 代理人 江慧 (51)Int.Cl. G16B 30/10 (2019.01) G16B 25/10 (2019.01) G16B 40/00 (2019.01) G16B 50/30 (2019.01) 权利要求书2页 说明书16页 附图5页 (54)发明名称 一种基于集成多组学分析预测QTL内候选基 因的方法和系统 (57)摘要 本发明公开了一种基于集成多组学分析预 测QTL内候选基因的方法和系统,所述方法包括: 选取母本和父本,将所述母本和父本杂交获得F1 代,单粒传种构建出重组自交系RILs;将所述重 组自交系RILs进行测序并构建遗传图谱,并进行 QTL分析,获得QTL区间及QTLs区间位置信息;于 公开数据库搜集目标性状相关的已知基因,并与 所述QTLs区间位置信息进行比较,获得候选基 因;将所述候选基因与父母本蛋白序列库进行比 对,获得存在差异的基因;后基因分型

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