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发明

基于XGBoost模型的20个藏羊品种分子鉴别的SNP位点组合及应用2024

2024-04-21 07:15:18 发布于四川 0
  • 申请专利号：CN202311547965.8
  • 公开（公告）日：2024-12-20
  • 公开（公告）号：CN117894368A
  • 申请人：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
摘要：本发明属于生物信息学及畜禽种质资源品种保护领域，本发明提供基于XGBoost模型的20个藏羊品种分子鉴别的SNP位点组合及应用。本发明所提供的SNP位点组合包括1192个SNP位点，更具体地，本发明中，将每个藏羊个体全基因组SNP位点组合的基因型，用0替代野生基因型，用1替代杂合基因型，用2替代突变基因型，输入到训练后的XGBoost模型中，获取待检测个体的藏羊品种信息。本发明基于机器学习的思想，充分结合了位点基因型与品种之间的相关关系，具有预测速度快、预测准确性高的显著效果。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 117894368 A (43)申请公布日 2024.04.16 (21)申请号 202311547965.8 G06N 5/01 (2023.01) C12Q 1/6888 (2018.01) (22)申请日 2023.11.20 (71)申请人 中国农业科学院北京畜牧兽医研究 所 地址 100193 北京市海淀区圆明园西路2号 (72)发明人 蒋琳　赵玉和田　马月辉　浦亚斌　 梁奔梦　 (74)专利代理机构 北京路浩知识产权代理有限 公司 11002 专利代理师 孙怡 (51)Int.Cl. G16B 20/30 (2019.01) G16B 20/20 (2019.01) G16B 40/00 (2019.01) G06N 20/20 (2019.01) 权利要求书11页 说明书15页 附图2页 (54)发明名称 基于XGBoost模型的20个藏羊品种分子鉴别 的SNP位点组合及应用 (57)摘要 本发明属于生物信息学及畜禽种质资源品 种保护领域，本发明提供基于XGBoost模型的20 个藏羊品种分子鉴别的SNP位点组合及应用。本 发明所提供的SNP位点组合包括1192个SNP位点， 更具体地，本发明中，将每个藏羊个体全基因组 SNP位点组合的基因型，用0替代

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