发明

基于单细胞数据的时间延迟的基因调控网络构建方法

2023-08-31 08:43:48 发布于四川 0
  • 申请专利号:CN202310627560.9
  • 公开(公告)日:2025-07-01
  • 公开(公告)号:CN116665770A
  • 申请人:西安电子科技大学
摘要:本发明提出了一种基于单细胞数据的时间延迟的基因调控网络构建方法。该方法基于单细胞数据计算基因的表达值方差,获取基因表达数据,基于时间延迟计算调控基因与靶基因间的最大互信息,构建基因调控网络。本发明的优点是:在单细胞数据中引入时间延迟因素,计算调控基因表达值与靶基因表达值之间的互信息、调控基因表达值与靶基因速率之间的互信息,获取不同时间延迟下互信息的最大值,以最高互信息值作为基因间的相互作用得分。本发明提高了基因调控网络推断的准确度,为挖掘基因间的联系提供了新的视角。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 116665770 A (43)申请公布日 2023.08.29 (21)申请号 202310627560.9 (22)申请日 2023.05.30 (71)申请人 西安电子科技大学 地址 710071 陕西省西安市雁塔区太白南 路2号 (72)发明人 黄晓太 吴浪浪  (74)专利代理机构 陕西电子工业专利中心 61205 专利代理师 陈宏社 (51)Int.Cl. G16B 20/00 (2019.01) G16B 30/10 (2019.01) G16B 40/20 (2019.01) G06F 18/241 (2023.01) G06F 18/214 (2023.01) 权利要求书2页 说明书4页 附图1页 (54)发明名称 基于单细胞数据的时间延迟的基因调控网 络构建方法 (57)摘要 本发明提出了一种基于单细胞数据的时间 延迟的基因调控网络构建方法。该方法基于单细 胞数据计算基因的表达值方差,获取基因表达数 据,基于时间延迟计算调控基因与靶基因间的最 大互信息,构建基因调控网络。本发明的优点是: 在单细胞数据中引入时间延迟因素,计算调控基 因表达值与靶基因表达值之间的互信息、调控基 因表达值与靶基因速率之间的互信息,获取不同 时间延迟下互信息的最大值,以最高互信息值作 为基因间的相互作用得分。本发明提高了基因调 控网络推断的准确度,为挖掘基

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