发明

一种环肽药物从头设计方法、电子设备、及存储介质2024

2023-12-17 07:32:44 发布于四川 0
  • 申请专利号:CN202310361849.0
  • 公开(公告)日:2024-12-17
  • 公开(公告)号:CN117219189A
  • 申请人:深圳太力生物技术有限责任公司
摘要:本发明公开了一种环肽药物从头设计方法、电子设备、及存储介质。所述方法包括:(1)筛选种子短肽;(2)肽段延伸;(3)备选肽段筛选:对于备选肽段采用蛋白质结构预测算法模拟其与目标蛋白的复合物结构;对于与目标蛋白的结合能力超过预设阈值的备选肽段获取其与目标蛋白的复合物结构中的构象;当备选肽段的构象形成二环肽或首尾相接的环肽时,结束肽段延伸将此备选肽段作为环肽药物候选结构;当备选肽段的构象形成长度超过预设阈值的线性肽时,结束肽段延伸;否则,进入步骤(2)。本发明在不依赖先验蛋白质热点残基信息的前提下,可直接设计可靶向目标蛋白分子的环肽,与先设计环肽库再筛选相比,节省绝大部分的筛选过程。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 117219189 A (43)申请公布日 2023.12.12 (21)申请号 202310361849.0 (22)申请日 2023.04.07 (71)申请人 深圳太力生物技术有限责任公司 地址 518048 广东省深圳市福田区福保街 道福保社区海红道1号综合信兴一期 三层323-M号 (72)发明人 陈亮 龙永康 胡志鹏 梁国龙  (74)专利代理机构 武汉臻诚专利代理事务所 (普通合伙) 42233 专利代理师 胡星驰 (51)Int.Cl. G16C 20/50 (2019.01) G16B 35/20 (2019.01) G16B 20/50 (2019.01) G16B 40/00 (2019.01) 权利要求书2页 说明书10页 序列表(电子公布) 附图8页 (54)发明名称 一种环肽药物从头设计方法、电子设备、及 存储介质 (57)摘要 本发明公开了一种环肽药物从头设计方法、 电子设备、及存储介质。所述方法包括:(1)筛选 种子短肽;(2)肽段延伸;(3)备选肽段筛选:对于 备选肽段采用蛋白质结构预测算法模拟其与目 标蛋白的复合物结构;对于与目标蛋白的结合能 力超过预设阈值的备选肽段获取其与目标蛋白 的复合物结构中的构象;当备选肽段的构象形成 二环

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