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发明

一种全基因组DNA胞嘧啶羟甲基化修饰的单碱基精确度建库方法

2023-05-28 11:47:17 发布于四川 1
  • 申请专利号：CN202310109550.6
  • 公开（公告）日：2023-05-23
  • 公开（公告）号：CN116145267A
  • 申请人：生工生物工程（上海）股份有限公司
摘要：本发明公开了一种全基因组DNA胞嘧啶羟甲基化修饰的单碱基精确度建库方法，涉及基因组学、表观遗传学和分子生物学技术领域。其内容包括如下步骤：5hmC标记反应；点击化学反应；样本DNA片段化；通过磁珠将片段化产物纯化；5hmC片段化DNA捕获；洗涤捕获产物；还原反应；APOBEC酶脱氨反应；脱氨产物的纯化；双链转化反应；末端修复和3′端加A反应；接头连接；连接产物纯化与双分选；文库扩增；文库纯化。该建库方法在保证数据真实的前提下，集低数据量、单碱基精确度和适用于常规双链建库试剂盒于一体。具有较高的通用性和数据高度可重复的技术优势。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 116145267 A (43)申请公布日 2023.05.23 (21)申请号 202310109550.6 (22)申请日 2023.02.13 (71)申请人 生工生物工程（上海）股份有限公司 地址 201600 上海市松江区香闵路698号 (72)发明人 陈清　赖伟　薛添香　张杰　 聂小挺　 (74)专利代理机构 北京超凡宏宇专利代理事务 所(特殊普通合伙) 11463 专利代理师 覃蛟 (51)Int.Cl. C40B 50/06 (2006.01) C40B 40/06 (2006.01) C12Q 1/6806 (2018.01) C12Q 1/6869 (2018.01) 权利要求书2页 说明书14页 序列表（电子公布） 附图2页 (54)发明名称 一种全基因组DNA胞嘧啶羟甲基化修饰的单 碱基精确度建库方法 (57)摘要 本发明公开了一种全基因组DNA胞嘧啶羟甲 基化修饰的单碱基精确度建库方法，涉及基因组 学、表观遗传学和分子生物学技术领域。其内容 包括如下步骤：5hmC标记反应；点击化学反应；样 本DNA片段化；通过磁珠将片段化产物纯化；5hmC 片段化DNA捕获；洗涤捕获产物；还原反应； APOBEC酶脱氨反应 ；脱氨产物的纯化；双链转化

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