发明

基于蛋白质结构的可控属性全新活性小分子设计方法2025

2023-09-18 07:28:20 发布于四川 0
  • 申请专利号:CN202310707583.0
  • 公开(公告)日:2025-07-11
  • 公开(公告)号:CN116758978A
  • 申请人:西北工业大学
摘要:本发明公开了一种基于蛋白质结构的可控属性全新活性小分子设计方法,提出了一个基于Transformer的小分子生成模型,即CproMG。基于融合蛋白质的层次视图,它通过将氨基酸残基与其组成原子关联,显著增强了蛋白质结合袋的表达。通过联合嵌入分子序列、其类药物性质和与蛋白质的结合亲和力,它通过测量分子标记与蛋白质残基和原子的接近度,以可控的方式自动回归生成具有所需财产的新分子。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 116758978 A (43)申请公布日 2023.09.15 (21)申请号 202310707583.0 (22)申请日 2023.06.15 (71)申请人 西北工业大学 地址 710072 陕西省西安市友谊西路127号 (72)发明人 施建宇 李嘉宁 杨光 赵鹏程  韦学鑫  (74)专利代理机构 西安匠星互智知识产权代理 有限公司 61291 专利代理师 屠沛 (51)Int.Cl. G16B 15/30 (2019.01) G16B 15/20 (2019.01) G16B 40/00 (2019.01) G06N 3/0455 (2023.01) 权利要求书5页 说明书7页 附图1页 (54)发明名称 基于蛋白质结构的可控属性全新活性小分 子设计方法 (57)摘要 本发明公开了一种基于蛋白质结构的可控 属性全新活性小分子设计方法,提出了一个基于 Transformer的小分子生成模型,即CproMG。基于 融合蛋白质的层次视图,它通过将氨基酸残基与 其组成原子关联,显著增强了蛋白质结合袋的表 达。通过联合嵌入分子序列、其类药物性质和与 蛋白质的结合亲和力,它通过测量分子标记与蛋 白质残基和原子的接近度,以可控的方式自动回 归生成具有所需财产的新分子。 A 8 7 9 8 5 7 6 1 1 N C CN 116758978 A

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