基于FPGA的重测序分析方法和装置

专利内容

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113168888 A (43)申请公布日 2021.07.23 (21)申请号 201880095562.5 (51)Int.Cl. G16B 30/00 (2006.01) (22)申请日 2018.10.23 (85)PCT国际申请进入国家阶段日 2021.01.11 (86)PCT国际申请的申请数据 PCT/CN2018/111357 2018.10.23 (87)PCT国际申请的公布数据 WO2020/082224 ZH 2020.04.30 (71)申请人 深圳华大智造科技股份有限公司 地址 518083 广东省深圳市盐田区北山工 业区综合楼及11栋2楼 (72)发明人 谢寅龙　黄伟华　陈辰　唐静波　 (74)专利代理机构 北京清亦华知识产权代理事 务所(普通合伙) 11201 代理人 肖阳 (54)发明名称 基于FPGA的重测序分析方法和装置 (57)摘要 本公开提出一种基于FPGA的重测序分析方 法和装置，其中，方法包括：接收基因组重测序数 据；将重测序数据作为FPGA的输入，根据FPGA的 输出确定重测序过程中的比对结果，同时，对比 对结果进行排序去重处理；对排序去重处理后的 比对结果进行碱基质量值的校正；根据校正后的 比对结果进行变异结果的检测。该方法能够实现 节省程序运行时间，节省计算成本，提升重测序 效率。 A