发明

一种染色质构象捕获方法

2023-07-21 07:19:33 发布于四川 0
  • 申请专利号:CN202110682551.0
  • 公开(公告)日:2023-07-18
  • 公开(公告)号:CN113466444A
  • 申请人:中山大学
摘要:本发明涉及生物领域,具体公开了一种染色质构象捕获方法。方法包括以下步骤:在细胞中进行原位邻近连接反应并用生物素标记连接位置;利用生物素抗体和二抗特异性识别邻近连接位置,通过pA与抗体的结合将pA‑Tn5中的Tn5靶向结合到邻近连接位置附近的DNA上,Tn5酶切打断邻近连接位置附近的DNA并同时接入N5接头序列;纯化DNA后用磁珠富集带有生物素的DNA为模板,利用观测位点的特异性引物和P5引物对模板DNA进行PCR扩增构建测序文库,测序和分析数据。该方法大幅度降低观测位点对限制性内切酶位点的依赖性,更高分辨率地检测观测位点参与的染色质三维构象,大幅度降低需要的细胞数量,可应用于临床样本。

专利内容

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113466444 A (43)申请公布日 2021.10.01 (21)申请号 202110682551.0 (22)申请日 2021.06.18 (71)申请人 中山大学 地址 510275 广东省广州市海珠区新港西 路135号 (72)发明人 唐忠辉 吴霞 刘蓉 熊丹  (74)专利代理机构 广州三环专利商标代理有限 公司 44202 代理人 颜希文 (51)Int.Cl. G01N 33/53 (2006.01) C40B 50/06 (2006.01) 权利要求书1页 说明书9页 序列表2页 附图2页 (54)发明名称 一种染色质构象捕获方法 (57)摘要 本发明涉及生物领域,具体公开了一种染色 质构象捕获方法。方法包括以下步骤:在细胞中 进行原位邻近连接反应并用生物素标记连接位 置;利用生物素抗体和二抗特异性识别邻近连接 位置,通过pA与抗体的结合将pA‑Tn5中的Tn5靶 向结合到邻近连接位置附近的DNA上,Tn5酶切打 断邻近连接位置附近的DNA并同时接入N5接头序 列;纯化DNA后用磁珠富集带有生物素的DNA为模 板,利用观测位点的特异性引物和P5引物对模板 DNA进行PCR扩增构建测序文库,测序和分析数 据。该方法大幅度降低观测位点对限制性内切酶 位点的依赖性,更

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