FFPE样本建库的方法及其应用

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(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113005525 A (43)申请公布日 2021.06.22 (21)申请号 202110506226.9 (22)申请日 2021.05.10 (71)申请人 纳昂达（南京）生物科技有限公司 地址 210000 江苏省南京市江北新区华康 路142号南京生物医药谷加速器三期 A01栋南侧3-4层 (72)发明人 胡玉刚　汪彪　郑文莉　吴强　 (74)专利代理机构 北京康信知识产权代理有限 责任公司 11240 代理人 路秀丽 (51)Int.Cl. C40B 50/06 (2006.01) C40B 40/06 (2006.01) C12Q 1/6869 (2018.01) 权利要求书1页 说明书11页 附图3页 (54)发明名称 FFPE样本建库的方法及其应用 (57)摘要 本发明提供了一种FFPE建库的方法及其应 用。该方法包括：通过利用内切酶进行酶切片段 化，对片段化DNA依次进行末端修复加A及接头连 接，对连上接头的DNA片段进行PCR扩增，得到测 序文库，其中内切酶具有如下功能：a)在DNA缺口 处切割；b)保留双链末端突出碱基部分。由于 FFPE在固定的过程中和固定之前都有带来降级 和部分碱基的脱落，该方法充分利用FFPE的本身 的缺口问题，能够在缺口处断裂DNA片段的酶打 断DNA后结合正常的补平加A、连接接头和PCR扩 增的方式进行建库，解决了由于FFPE本身的