一种在全基因组水平上预测植物生长发育转录因子调控的下游靶基因的方法

专利内容

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114427116 A (43)申请公布日 2022.05.03 (21)申请号 202111635093.1 (22)申请日 2021.12.29 (71)申请人 北京林业大学 地址 100083 北京市海淀区清华东路35号 (72)发明人 张德强　徐伟杰　谢剑波　 (74)专利代理机构 北京高沃律师事务所 11569 代理人 张梦泽 (51)Int.Cl. C40B 50/06 (2006.01) C12Q 1/6806 (2018.01) C12Q 1/6895 (2018.01) C12Q 1/6869 (2018.01) G16B 20/30 (2019.01) 权利要求书2页 说明书8页 序列表1页 附图4页 (54)发明名称 一种在全基因组水平上预测植物生长发育 转录因子调控的下游靶基因的方法 (57)摘要 本发明提供了一种在全基因组水平上预测 植物生长发育转录因子调控的下游靶基因的方 法，属于生物信息技术领域。本发明的方法基于 植物转录因子的DAP‑seq测序数据，在全基因组 中检测调控的启动子的Motif元件和位置，并以 此为基础，预测转录因子下游调控的靶基因。本 发明联合测序数据和生物信息学工具，大大增加 了预测的精确度和通量，进而可在大数据量的基 础上快速预测出靶基因，提高预测效率。并