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发明

基于核酸适体测序的单细胞图谱分析2024

2024-02-15 07:47:06 发布于四川 2
  • 申请专利号：CN202311275408.5
  • 公开（公告）日：2024-02-13
  • 公开（公告）号：CN117552114A
  • 申请人：中国科学院基础医学与肿瘤研究所（筹）
摘要：本发明公开了基于核酸适体测序的单细胞图谱分析，即HIMseq。此技术利用核酸适体代替抗体用以定量测定细胞表面分子的丰度，将此方法与目前表征细胞膜蛋白水平的金标准技术—流式细胞术进行了比较，发现核酸适体测序的结果与流式细胞仪的检测结果具有显著相关性，初步证明了用核酸适体测序表征细胞膜蛋白的可行性。进一步地，通过改造核酸适体使其与现有的单细胞转录组测序平台兼容，实现了细胞系和临床样本中转录组和表面膜蛋白组的同时数字化。通过实施单细胞HIM Apt‑seq(scHIM‑seq)，本发明比较了5‑氟尿嘧啶敏感和耐药性结肠癌细胞分别结合的核酸适体数量，发现了一种可能与5‑氟尿嘧啶耐药相关的干预靶点，值得一提的是这一靶点仅用转录组数据是无法发现的。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 117552114 A (43)申请公布日 2024.02.13 (21)申请号 202311275408.5 C12N 15/115 (2010.01) C12Q 1/6869 (2018.01) (22)申请日 2023.09.28 (71)申请人 中国科学院基础医学与肿瘤研究所 （筹） 地址 310018 浙江省杭州市钱塘区下沙街 道东方街150号中国科学院基础医学 与肿瘤研究所 (72)发明人 谭蔚泓　邴涛　武晓秋　刘雨晴　 宋佳　符婷　吴芩　 (74)专利代理机构 北京知元同创知识产权代理 事务所(普通合伙) 11535 专利代理师 吕少楠 (51)Int.Cl. C40B 40/06 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01) 权利要求书2页 说明书17页 附图11页 (54)发明名称 基于核酸适体测序的单细胞图谱分析 (57)摘要 本发明公开了基于核酸适体测序的单细胞 图谱分析，即HIMseq。此技术利用核酸适体代替 抗体用以定量测定细胞表面分子的丰度，将此方 法与目前表征细胞膜蛋白水平的金标准技术— 流式细胞术进行了比较，发现核酸适体测序的结 果与流式细胞仪的检测结果具有显著相关性，初 步证明了用核酸适体测序表征细胞膜蛋

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