发明

一种捕获全长非编码RNA测序文库的构建方法与应用

2023-08-03 07:13:40 发布于四川 1
  • 申请专利号:CN202310366344.3
  • 公开(公告)日:2023-08-01
  • 公开(公告)号:CN116516495A
  • 申请人:中山大学
摘要:本发明公开了一种捕获全长非编码RNA测序文库的构建方法与应用。该方法包括:步骤S1、获得待测样本的RNA,并在RNA的两端分别连接3’DNA接头和5’RNA接头,得到RNA连接产物;步骤S2、将RNA连接产物与靶向非目标RNA的DNA探针混合进行退火,去除非目标RNA和残余的DNA探针,得到目标RNA连接产物;步骤S3、针对目标RNA连接产物设计截短型的逆转录引物并合成cDNA,然后使用含锚定碱基的引物对cDNA进行PCR扩增即得。本发明的构建方法能够捕获ncRNA的末端信息,并提高目标ncRNA的测序序列的比率,显著减少无用测序并降低测序成本,同时还能提高对中低丰度ncRNA检测的准确性。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 116516495 A (43)申请公布日 2023.08.01 (21)申请号 202310366344.3 (22)申请日 2023.04.06 (71)申请人 中山大学 地址 510275 广东省广州市新港西路135号 (72)发明人 杨建华 李斌 屈良鹄  (74)专利代理机构 广州嘉权专利商标事务所有 限公司 44205 专利代理师 薛建强 (51)Int.Cl. C40B 50/06 (2006.01) C12Q 1/6806 (2018.01) C12Q 1/6869 (2018.01) C12N 15/11 (2006.01) 权利要求书1页 说明书20页 序列表(电子公布) 附图14页 (54)发明名称 一种捕获全长非编码RNA测序文库的构建方 法与应用 (57)摘要 本发明公开了一种捕获全长非编码RNA测序 文库的构建方法与应用。该方法包括:步骤S1、获 得待测样本的RNA,并在RNA的两端分别连接3’ DNA接头和5’RNA接头 ,得到RNA连接产物 ;步骤 S2、将RNA连接产物与靶向非目标RNA的DNA探针 混合进行退火,去除非目标RNA和残余的DNA探 针,得到目标RNA连接产物;步骤S3、针对目标RNA 连接产物设计截短型的逆转录引物并合成cDNA, 然后使用含锚定碱基的

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