发明

一种不依赖微流控芯片的超高通量单细胞转录组测序文库的构建方法2024

2024-01-30 07:12:59 发布于四川 0
  • 申请专利号:CN202311190475.7
  • 公开(公告)日:2024-01-26
  • 公开(公告)号:CN117448971A
  • 申请人:南方科技大学
摘要:本发明公开一种不依赖微流控芯片的超高通量单细胞转录组测序文库的构建方法。该方法包括:对细胞进行固定处理和透化处理,得到细胞核;利用带有第一轮样本标签序列的特异性逆转录引物1,在细胞核原位逆转录合成mRNA‑cDNA杂合双链;利用Tn5转座子在mRNA‑cDNA杂合双链上添加测序接头;采用基于震荡的微滴包裹方法,使偶联捕获序列的凝珠与转座后的细胞核包裹在油包水结构中,得到微滴;利用预扩增引物对微滴内核酸片段进行文库预扩增,得到预文库;利用带有第二轮样本标签序列的引物2对预文库进行最终扩增,得到单细胞转录组测序文库。采用该方法,避免了对仪器平台的依赖,简化了反应流程,降低了反应成本,提高了单次反应检测的细胞数量。

专利内容

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 117448971 A (43)申请公布日 2024.01.26 (21)申请号 202311190475.7 (22)申请日 2023.09.14 (71)申请人 南方科技大学 地址 518055 广东省深圳市南山区桃源街 道学苑大道1088号 (72)发明人 陈曦 徐玮  (74)专利代理机构 深圳市君胜知识产权代理事 务所(普通合伙) 44268 专利代理师 孙果 (51)Int.Cl. C40B 50/06 (2006.01) C12Q 1/6806 (2018.01) C40B 40/02 (2006.01) 权利要求书2页 说明书11页 序列表(电子公布) 附图1页 (54)发明名称 一种不依赖微流控芯片的超高通量单细胞 转录组测序文库的构建方法 (57)摘要 本发明公开一种不依赖微流控芯片的超高 通量单细胞转录组测序文库的构建方法。该方法 包括:对细胞进行固定处理和透化处理,得到细 胞核;利用带有第一轮样本标签序列的特异性逆 转录引物1,在细胞核原位逆转录合成mRNA‑cDNA 杂合双链;利用Tn5转座子在mRNA‑cDNA杂合双链 上添加测序接头;采用基于震荡的微滴包裹方 法,使偶联捕获序列的凝珠与转座后的细胞核包 裹在油包水结构中,得到微滴;利用预扩增引物 对微滴内核酸片

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